Самоукина А.М. с отличием окончила Тверскую ГМА в 1997 г. с присуждением квалификации – «лечебное дело». С 1997 по 2003 гг. обучалась в клинической ординатуре на кафедре госпитальной терапии по специальности "Терапия". С 2003 по 2006 г. проходила обучение в очной аспирантуре ТГМА. Защита диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальности «Микробиология» состоялась 18.04.2006 г. в ММА им. И.М. Сеченова по теме: «Перспективные штаммы энтерококков и лактококков для создания новых пробиотических препаратов». Ученая степень кандидата медицинских наук присвоена 07.07.2006 г. С 2005 г. – ассистент, с 2006 г. – старший преподаватель, с 2008 г. доцент кафедры микробиологии и вирусологии с курсом иммунологии. Ученое звание доцента присвоено 20.10.2010 г. С 2018 по 2020 гг. – старший научный сотрудник и заведующая научно-исследовательской лаборатории ТвГМУ, с 2019 г. по настоящее время – начальник научного отдела и ответственный секретарь приемной комиссии. В сентябре 2021 года избрана по конкурсу на должность заведующей кафедры гигиены и экологии.

Самоукина А.М. принимает активное участие в научно-исследовательской работе: Грант Федерального агентства по науке и инновациям по теме «Разработка высокоантагонистических штаммов лактобацилл и энтерококков перспективных для конструирования новых пробиотических препаратов» (2007 г.), «Исследование антагонистической активности штаммов стартерных культур заквасок прямого внесения (ЗПВ)», в 2013-2015 гг. НИР «Проблемы формирования здоровья детей подросткового возраста в современных социально-средовых условиях» Научная платформа «Педиатрия» (Приказ № 281 МЗ РФ от 30.04.2013 г), в 2018-2021 гг. «Разработка комплексной научно-обоснованной программы профилактики и лечения дисбиотических нарушений желудочно-кишечного тракта у детей первого года жизни с различным уровнем здоровья» (ГЗ № 056-00150-18-00 от 27.12.2017 г.).

В декабре 2008 г. прошла сертификационные курсы по программе «ПЦР диагностика инфекционных заболеваний», сертифицирована по специальности «Бактериология» с 2005 года. С 2009 по 2014 гг. работала врачом-бактериологом в молекулярно-генетической лаборатории КДЛ КДЦ ТГМА (ПЦР диагностика инфекций, передаваемых половым путем).

Самоукина А.М. имеет 168 публикаций, из них 66 учебно-методических, 93 научных (41 в изданиях, по списку ВАК), 6 патентов на изобретение, 3 свидетельства на ноу-хау, 5 свидетельств на базы данных и 1 свидетельство на программу ЭВМ. Индекс цитируемости РИНЦ -275, индекс Хирша – 10.

Систематически повышает свою профессиональную и педагогическую квалификацию.: «Основы клинической генетики и достижения современной молекулярной медицины», «ПЦР-диагностика инфекционных заболеваний», «Бактериология» (2005, , «Психология и педагогика высшей школы», «Разработка и внедрение основных образовательных программ высшего профессионального медицинского образования в связи с переходом на ФГОС», «Управление исследовательскими биотехнологическими проектами и возможности сотрудничества в 7-ой Рамочной программе Европейского Союза», «Преподавание в высшей медицинской школе в условиях модернизации высшего образования», «Инновационные и классические технологии медицинского образования и здравоохранения», «Современные правила проведения клинических испытаний медицинских изделий (надлежащая клиническая практика)».

Самоукина А.М. является экспертом по проведению клинических испытаний медицинских изделий, в 2018 году приняла участие в испытаниях более 30 медицинских изделий.